Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
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