Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
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