Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms