Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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ODF1Q14990 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ODF1Q14990 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ODF1Q14990 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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ODF1Q14990 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ODF1Q14990 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ODF1Q14990 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ODF1Q14990 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ODF1Q14990 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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