Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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RAB39AQ14964 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RAB39AQ14964 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RAB39AQ14964 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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RAB39AQ14964 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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RAB39AQ14964 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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RAB39AQ14964 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB39AQ14964 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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