Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC1AQ14683 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC1AQ14683 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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