Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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