Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIM25Q14258 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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