Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE1CQ14123 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE1CQ14123 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE1CQ14123 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE1CQ14123 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE1CQ14123 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE1CQ14123 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1CQ14123 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1CQ14123 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1CQ14123 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1CQ14123 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1CQ14123 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1CQ14123 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1CQ14123 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1CQ14123 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1CQ14123 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE1CQ14123 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE1CQ14123 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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