Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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COL9A2Q14055 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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COL9A2Q14055 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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