Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXOSC2Q13868 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
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