Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RAB31Q13636 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RAB31Q13636 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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RAB31Q13636 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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RAB31Q13636 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB31Q13636 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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RAB31Q13636 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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RAB31Q13636 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RAB31Q13636 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RAB31Q13636 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB31Q13636 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms