Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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CDH18Q13634 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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