Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAE1Q13564 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NAE1Q13564 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms