Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
HDAC1Q13547 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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