Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGB3BPQ13352 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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