Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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