Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERCC8Q13216 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms