Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF1Q13077 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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