Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNIP3Q12983 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BNIP3Q12983 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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