Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIAQ12857 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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