Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YNR021WYNR021W 1215 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YOR029WYOR029W 336 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 MDN1YLR106C 14733 nt3.36□□□□□ -1.87
HER1Q12276 SNU56YDR240C 1479 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 ANR2YKL047W 1551 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 STE14YDR410C 720 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 ECM11YDR446W 909 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 PRM8YGL053W 714 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YGR228WYGR228W 345 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 ASG7YJL170C 630 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YKL070WYKL070W 510 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 XRN1YGL173C 4587 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 PEX1YKL197C 3132 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 MIT1YEL007W 2001 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 VBA4YDR119W 2307 nt3.35□□□□□ -1.87
HER1Q12276 SEA4YBL104C 3117 nt3.34□□□□□ -1.87
HER1Q12276 GRX2YDR513W 432 nt3.34□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YER175W-AYER175W-A 165 nt3.34□□□□□ -1.87
HER1Q12276 FAR7YFR008W 666 nt3.34□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RPL9AYGL147C 576 nt3.34□□□□□ -1.87
HER1Q12276 GOS1YHL031C 672 nt3.34□□□□□ -1.87
HER1Q12276 SPO13YHR014W 876 nt3.34□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RGI2YIL057C 495 nt3.34□□□□□ -1.87
HER1Q12276 RPS21AYKR057W 264 nt3.34□□□□□ -1.87
HER1Q12276 BET5YML077W 480 nt3.34□□□□□ -1.87
HER1Q12276 YBR012CYBR012C 420 nt3.34□□□□□ -1.87
HER1Q12276 PKP2YGL059W 1476 nt3.34□□□□□ -1.88
HER1Q12276 VHR1YIL056W 1923 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 SMT3YDR510W 306 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 USE1YGL098W 738 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 VPH2YKL119C 648 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YLL044WYLL044W 447 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 RNH203YLR154C 333 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YAR047CYAR047C 321 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 ILV5YLR355C 1188 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YML003WYML003W 873 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 SEC66YBR171W 621 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 snR41snR41 95 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 AVT5YBL089W 1380 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 UBP16YPL072W 1500 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 AUS1YOR011W 4185 nt3.33□□□□□ -1.88
HER1Q12276 CHA4YLR098C 1947 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 ASI3YNL008C 2031 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 NDC80YIL144W 2076 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 LRG1YDL240W 3054 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 VIP1YLR410W 3441 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 RRP42YDL111C 798 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 BNA7YDR428C 786 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YER119C-AYER119C-A 372 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 VFA1YER128W 612 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 HUR1YGL168W 333 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 SAE2YGL175C 1038 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 RPL17BYJL177W 555 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 PIR1YKL164C 1026 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 VPS51YKR020W 495 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 HRI1YLR301W 735 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YNL276CYNL276C 396 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YPR053CYPR053C 456 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YML096WYML096W 1578 nt3.32□□□□□ -1.88
HER1Q12276 TPO5YKL174C 1857 nt3.31□□□□□ -1.88
HER1Q12276 COX19YLL018C-A 297 nt3.31□□□□□ -1.88
HER1Q12276 GTT2YLL060C 702 nt3.31□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YLR297WYLR297W 390 nt3.31□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YBR137WYBR137W 540 nt3.31□□□□□ -1.88
HER1Q12276 CIN1YOR349W 3045 nt3.31□□□□□ -1.88
HER1Q12276 FUS2YMR232W 2034 nt3.31□□□□□ -1.88
HER1Q12276 RRP5YMR229C 5190 nt3.3□□□□□ -1.88
HER1Q12276 FLO9YAL063C 3969 nt3.3□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YDR193WYDR193W 399 nt3.3□□□□□ -1.88
HER1Q12276 CHZ1YER030W 462 nt3.3□□□□□ -1.88
HER1Q12276 RPL22AYLR061W 366 nt3.3□□□□□ -1.88
HER1Q12276 OST6YML019W 999 nt3.3□□□□□ -1.88
HER1Q12276 PBI2YNL015W 228 nt3.3□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YPL034WYPL034W 498 nt3.3□□□□□ -1.88
HER1Q12276 SLA1YBL007C 3735 nt3.3□□□□□ -1.88
HER1Q12276 IOC3YFR013W 2364 nt3.3□□□□□ -1.88
HER1Q12276 SKO1YNL167C 1944 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 LCB4YOR171C 1875 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 SQS1YNL224C 2304 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YCR064CYCR064C 411 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 AAD3YCR107W 1092 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YDL071CYDL071C 375 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 HLR1YDR528W 1272 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 TDA2YER071C 381 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YGR039WYGR039W 312 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 SDP1YIL113W 630 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 HHF2YNL030W 312 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 GPI15YNL038W 690 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YNL146WYNL146W 303 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 TIR2YOR010C 756 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YOR203WYOR203W 354 nt3.29□□□□□ -1.88
HER1Q12276 SNT1YCR033W 3681 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YDR269CYDR269C 324 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 BCD1YHR040W 1101 nt3.28□□□□□ -1.88
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