Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCBP1Q09161 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms