Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PUDPQ08623 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms