Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF4Q08170 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms