Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms