Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBQ06643 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LTBQ06643 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LTBQ06643 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBQ06643 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBQ06643 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBQ06643 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBQ06643 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBQ06643 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBQ06643 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBQ06643 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LTBQ06643 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LTBQ06643 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LTBQ06643 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms