Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEUP1Q05D60 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEUP1Q05D60 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms