Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNB3Q05901 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNB3Q05901 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms