Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALD1Q05682 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms