Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ATP7AQ04656 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATP7AQ04656 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms