Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAP2Q03519 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAP2Q03519 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms