Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLOD1Q02809 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLOD1Q02809 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms