Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB1Q02641 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms