Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ID3Q02535 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ID3Q02535 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ID3Q02535 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ID3Q02535 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ID3Q02535 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ID3Q02535 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms