Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms