Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEX3Q00994 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms