Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK16Q00536 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms