Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRB1P82279 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CRB1P82279 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRB1P82279 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRB1P82279 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRB1P82279 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRB1P82279 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRB1P82279 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRB1P82279 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRB1P82279 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRB1P82279 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRB1P82279 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRB1P82279 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CRB1P82279 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRB1P82279 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CRB1P82279 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRB1P82279 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CRB1P82279 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRB1P82279 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRB1P82279 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRB1P82279 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRB1P82279 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRB1P82279 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CRB1P82279 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRB1P82279 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRB1P82279 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRB1P82279 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRB1P82279 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CRB1P82279 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRB1P82279 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRB1P82279 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRB1P82279 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRB1P82279 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRB1P82279 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRB1P82279 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRB1P82279 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms