Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRX1P78414 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRX1P78414 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRX1P78414 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRX1P78414 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRX1P78414 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRX1P78414 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRX1P78414 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRX1P78414 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRX1P78414 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRX1P78414 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRX1P78414 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRX1P78414 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRX1P78414 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRX1P78414 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRX1P78414 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms