Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVS71-1P61550 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms