Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVPABLB-1P60509 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms