Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00310P59036 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00310P59036 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms