Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAP1L1P55209 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAP1L1P55209 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms