Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF10P55107 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF10P55107 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF10P55107 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF10P55107 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF10P55107 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF10P55107 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF10P55107 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF10P55107 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF10P55107 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF10P55107 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF10P55107 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF10P55107 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF10P55107 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF10P55107 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF10P55107 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF10P55107 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF10P55107 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF10P55107 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF10P55107 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GDF10P55107 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GDF10P55107 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GDF10P55107 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GDF10P55107 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF10P55107 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF10P55107 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms