Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms