Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YARSP54577 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YARSP54577 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YARSP54577 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YARSP54577 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YARSP54577 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YARSP54577 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YARSP54577 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
YARSP54577 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YARSP54577 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YARSP54577 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YARSP54577 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YARSP54577 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YARSP54577 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YARSP54577 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YARSP54577 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YARSP54577 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YARSP54577 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YARSP54577 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YARSP54577 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms