Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PGGT1BP53609 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PGGT1BP53609 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PGGT1BP53609 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PGGT1BP53609 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PGGT1BP53609 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PGGT1BP53609 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PGGT1BP53609 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PGGT1BP53609 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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