Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LBX1P52954 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LBX1P52954 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LBX1P52954 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBX1P52954 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBX1P52954 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBX1P52954 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBX1P52954 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBX1P52954 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBX1P52954 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBX1P52954 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBX1P52954 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBX1P52954 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LBX1P52954 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LBX1P52954 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LBX1P52954 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LBX1P52954 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LBX1P52954 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LBX1P52954 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LBX1P52954 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LBX1P52954 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LBX1P52954 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LBX1P52954 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LBX1P52954 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LBX1P52954 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LBX1P52954 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LBX1P52954 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LBX1P52954 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms