Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RORCP51449 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RORCP51449 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RORCP51449 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RORCP51449 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RORCP51449 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RORCP51449 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RORCP51449 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RORCP51449 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RORCP51449 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RORCP51449 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RORCP51449 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RORCP51449 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RORCP51449 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RORCP51449 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RORCP51449 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RORCP51449 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms